למעלה ביואינפורמטיקה עבור Linux

CodonW היא תכנית שנועדה לפשט את הניתוח רב משתני (ניתוח התכתבות) של שימוש בחומצת אמינו וקודון. הוא גם מחשב מדדים סטנדרטיים של שימוש קודון. יש לו שני תפריט וממשקי שורת הפקודה.פרויקט CodonW נכתב על ידי ג'ון Peden במעבדה של פול שארפ, מחלקה לגנטיקה,...

LSim superposes צפיפות אלקטרונים macromolecular ומחשב ציון דמיון מבני. החישובים שלה בקנה מידה באופן ליניארי עם הגודל של המולקולות מושווים.יישור LSim הוא מושגית שאינו קשור לאלמנטים מבניים ביוכימיים, ולכן, אינם מוטים ומתאימים ללימודי דמיון חלבון מבנה...

CLC רצף Viewer יוצר סביבת תוכנה המאפשרת למשתמשים לבצע ביואינפורמטיקה הבסיסית ניתוחים וניהול נתונים חלקים, בשילוב עם אפשרויות צפייה ופלט גרפיות מצוינות.הנה כמה תכונות עיקריות של "CLC Workbench חינם":- GenBank חיפוש והצגה (ליניארי ונוף מעגלי)- יישור מרובה...

CLC Workbench DNA יוצר סביבת תוכנה המאפשרת למשתמשים לבצע מספר רב של רצף ה- DNA המתקדם מנתח, בשילוב עם ניהול חלק נתונים, ואפשרויות צפייה ופלט גרפיות מצוינות.CLC Workbench DNA הוא זמין ב- Windows, Mac OS X, ופלטפורמות לינוקס תכונות :. ביואינפורמטיקה...

MetagenomeDB היא ספריית פייתון נועד לאחסן בקלות, לאחזר ויסמנו רצפי metagenomic & nbsp;. מעשה MetagenomeDB כשכבת הפשטה על גבי מסד נתוני MongoDB. הוא מספק API כדי ליצור ולשנות ולחבר את שני סוגים של אובייקטים, כלומר רצפים ואוספים:& Nbsp; * רצפים (כיתת רצף)...

Staden החבילה היא קבוצה מפותחת של הרכבה רצף ה- DNA (Gap4), עריכה וכלי ניתוח (ספין) ליוניקס, לינוקס, MacOSX ו- MS Windows.בחזית Gap4 היו כמה קטין הצטרפות קשורשיפורים באיך זה עשרות מצטרף מצא פנימי מצטרף והפונקציונליות של כפתור היישור בעורך הצטרף.גם של תוצאה...

ProteinShop הוא כלי אינטראקטיבי למניפולצית מבנים חלבוניים. הוא נועד ליצור קבוצה של תצורות חלבון באמצעות ידע ואינטואיציה אנושיים במהירות. יכולות להיות נתונה תצורות אלה לאופטימיזציה מקומית או גלובלית. למרות ProteinShopאינו מבצע אופטימיזציה של התהליך הגלובלי...

. ביין הוא מנהל LIMS ועבודה זעירים לביואינפורמטיקה, נכתב בפייתון דרישות : ...

חבילת ספקטרומטר מסה massXpert היא סביבת ספקטרומטר מסה ליניארי (ביולוגי) פולימרים. זה יורש את כל החידושים של polyxmass של גנו, כפי שהוא יציאתו של פרויקט שלסביבת פיתוח פלטפורמות מה חדש בהודעה זו:. שיפורים במודול XpertMiner שיהפכו את העבודה עם...

מערכת E-Cell היא מושג של בניית תאים וירטואליים במחשבים.מערכת E-Cell היא חבילת תוכנה מונחה עצמים לדוגמנות, סימולציה, וניתוח של מערכות מורכבות בקנה מידה גדולה, כגון תאים ביולוגיים, הארכיטקטורה ידי Kouichi טקהאשי ונכתב על ידי צוות נפלא של מפתחים. חלק ליבה של...