למעלה ביואינפורמטיקה עבור Linux

Ghemical היא חבילת תוכנת כימיה חישובית שוחררה תחת GNU GPL. זה אומר שהקוד מקור מלא של החבילה הוא זמין, והמשתמשים חופשיים ללמוד ולשנות את החבילה. Ghemical כתוב ב- C ++.יש פרויקט Ghemical ממשק משתמש גרפי (המבוסס על GNOME), והוא תומך בשני הקוונטים-מכניקה...

SyntenyMiner הוא יישום לדמיין ולחקור את ההשוואות בין רצפי גנום שלמים מרובים. הממשק מספק תצוגת ניווט של התאמות לרצף הגנום התייחסות. רצף התאמות בין כרומוזומים של הגנום שונה יכולים להיבחן נוסף בהקשר של עלילת נקודה, חושפים rearragements הגנום שני בקנה המידה...

mpiBLAST הוא יישום מקביל מבוסס MPI של תפציץ צמח השדה. הפרויקט מורכב משתי תוכניות שתחלפנה formatdb וblastall עם גרסאות שביצוע עבודות פיצוץ במקביל באשכול של מחשבים עם MPI המותקנים. ישנם שני יתרונות עיקריים לשימוש בmpiBLAST לעומת פיצוץ מסורתי.ראשית, mpiBLAST...

מתכנן RFLP הוא כלי שעוזר לתכנן ניסוי RFLP: הוא מוצא אנזימי הגבלה, כי לחתוך קבוצה של רצפי DNA homologue בדרכים שונות ומדמה את תמונת אלקטרופורזה ג'ל וכתוצאה מכך. התכנית מסייעת לך למצוא את אנזימי הגבלה החיוניים המאפיינים את האוכלוסייה. עם הסימולציה...

פרויקט Adun היא תכנית סימולציה biomolecular להרחבה, הכוללת יכולות ניהול נתונים וניתוח.Adun מספק אלגוריתמים מתקדמים ופרוטוקולים לסימולציה מולקולרית אשר ניתן לגשת מממשק משתמש אינטואיטיבי, אלא גם מרמה תכנותית לגמישה יותר. היא בנויה על מסגרת Adun שהיא ספרייה...

GDIS הוא GTK תכנית מבוססת על התצוגה והמניפולציה של מולקולות בודדות ומערכות תקופתיות. תוכנה זו היא בפיתוח, אבל בכל זאת די פונקציונלי.הנה כמה תכונות עיקריות של...

מערכת benchmark ביואינפורמטיקה הוא ניסיון לבנות מסגרת סבירה בדיקות, בדיקות, ונתונים, כדי לאפשר למשתמשי קצה וספקים כדי לחקור את הביצועים של המערכות שלהם.מה שאנחנו מנסים לעשות הוא ליצור מסגרת לבדיקה, ומערכת ליבה של בדיקות שכל יכול להוריד ולהשתמש בו כדי...

pyNetConv היא ספריית פייתון נוצרה כדי לעזור המרה של כמה פורמטים של קבצים ברשת.מאז גרסה 0.6, pyNetConv מסוגל קריאה / כתיבה (ולהמיר מ / ל) הפורמטים של הקבצים...

NetAtlas הוא תוסף Cytoscape שמשתמש בנתוני ביטוי גנים ברקמות כדי לסנן רשת איתות תאית. NetAtlas מזהה רשתות מוגדרות רקמה, רכיבי רשת רקמות ספציפיות, ורכיבים עם ביטוי מתואם על פני...

MacMolPlt היא תכנית הגרפיקה מודרנית לזוממים מבנים מולקולריים 3-D ומצבים נורמלים (תנודות). אמצעים...