למעלה ביואינפורמטיקה עבור Linux

. HTSeq היא מסגרת פייתון לעבד ולנתח נתונים מרצף תפוקה גבוהה (HTS) מבחני דרישות : < li>...

אורנג-ביואינפורמטיקה היא אורנג 'חבילת תוכנת כריית נתונים תוספות על & nbsp;. היא משתרעת אורנג' על ידי מתן פונקציונלי משותף למשימות בסיסיות ביואינפורמטיקה. הוא גם מספק יישומונים לאורנג בד, המאפשרים למשתמשים שאינם מתכנתים לנהל זרימת microarray...

edittag הוא אוסף בקשה לעיצוב סטים של תגי רצף מטרי עריכה, בדיקת תגי רצף לקונפורמציה למדד לערוך, ושילוב תגי רצף למתאמי רצף פלטפורמה ספציפית ופריימרים PCR. edittag שונה מגישות אחרות:& Nbsp; * edittag מייצר אורכים שרירותיים של תגי רצף עריכה-מטרי במסגרות זמן...

פרויקט VULCAN מספק ניתוח דינמיקה של נוזלים חישובית.VULCAN (הצמיג נגד רוח אלגוריתם לזרימת ניתוח מורכב) מציע דינמיקה של נוזלים חישובית למהירות תת-קולית דרך סוער קולי מגיב ולא מגיב תזרים על מגוון רחב של פלטפורמות חישובית סידוריים ומקבילות.העלות החישובית של...

seriesoftubes הוא צינור ארוך לנתונים שבב seq Solexa.תיעוד חבילה דרישות : ...

reciprocal_smallest_distance הוא אלגוריתם orthology pairwise המשתמש ביישור רצף גלובלי ומרחק האבולוציוני סבירות המרבית בין רצפים במדויק למזהה orthologs בין הגנום. התקנה מtarball הורד וuntar את הגרסה האחרונה מGitHub:cd ~ס תלתל...

לבנות מערכות כמו איפור משמש לעתים קרובות כדי ליצור זרימות עבודה מסובכות, למשל ביואינפורמטיקה & nbsp;. snakemake שואף לצמצם את המורכבות של תהליכי עבודה יצירת על ידי מתן שפה נקייה ומודרנית תחום ספציפי מפרט (DSL) בסגנון פיתון, יחד עם סביבת ביצוע מהירה ונוחה....

פרויקט Geant4 הוא ערכת כלים לסימולציה של המעבר של חלקיקים דרך חומר.תחומי היישום שלה כוללים פיסיקה של אנרגיות גבוהות וניסויים גרעיניים, מחקרים רפואיים, מאיץ והפיזיקה החלל מה חדש בהודעה זו :. דגם חדש של אינטראקציות גרעיניות גמא באמצעות המפל ברתיני...

פרויקט STEME התחיל את חיי כקירוב לאלגוריתם הציפייה-Maximisation לסוג של מודל המשמש במד מוטיב כגון מם.STEME & rsquo; קירוב EM של פועל בסדר גודל יותר מהר מאשר יישום מם להגדרות פרמטר טיפוסיים. STEME עכשיו התפתח מאתר מוטיב באופן מלא לכל דבר בפני עצמו. למה...

Genepidgin היא חבילה של כלים Python המסייעים בשמות אחרים של מוצרים והערכת גן המשימה & nbsp; יש שלושה מרכיבים עיקריים.:genepidgin * נקי *& Nbsp; סטנדרטיזציה גן שמות להנחיות שמות Uniprotgenepidgin * להשוות *& Nbsp; משווה שניים או יותר סטים של שמות...