חדש ביואינפורמטיקה עבור Linux

חבילת ספקטרומטר מסה massXpert היא סביבת ספקטרומטר מסה ליניארי (ביולוגי) פולימרים. זה יורש את כל החידושים של polyxmass של גנו, כפי שהוא יציאתו של פרויקט שלסביבת פיתוח פלטפורמות מה חדש בהודעה זו:. שיפורים במודול XpertMiner שיהפכו את העבודה עם...

מערכת E-Cell היא מושג של בניית תאים וירטואליים במחשבים.מערכת E-Cell היא חבילת תוכנה מונחה עצמים לדוגמנות, סימולציה, וניתוח של מערכות מורכבות בקנה מידה גדולה, כגון תאים ביולוגיים, הארכיטקטורה ידי Kouichi טקהאשי ונכתב על ידי צוות נפלא של מפתחים. חלק ליבה של...

AHREA היא חבילת תכנה שהופכת את מציאת ביטוי יחסי לומדים קלים. . זה כתוב בפייתון דרישות : ...

אררו הוא מבוסס על MACS (דגם ניתוח מבוסס על נתונים שבב Seq).רצף תפוקה גבוהה מצמידים את המשקעים חיסוניים הכרומטין (שבב Seq) נמצא בשימוש נרחב באפיון הגנום דפוסים מחייבים של גורמי שעתוק, קו-פקטורים, מכפילי הכרומטין, וחלבוני DNA מחייב אחרים. צעד מפתח בניתוח...

CWC Simulator היא C ++ יישום CWC, חצץ לייצוג וסימולציה של מערכות ביולוגיות & nbsp;. לאחר התקנה מוצלחת (ראה התקנה) אתה תהיה מסוגל להריץ סימולציות על מודלים CWC, כפי שמוצג בכמה דוגמאות (ראה דוגמאות /).(שורת הפקודה) ממשק כמשתמש גנרי, אתה צריך לרוץ:model.cwc...

Syntainia הוא יישום חדשני להדמיה של הגנום מרובה & nbsp;. הוא מציג ממשק משתמש פשוט ואינטואיטיבי להציג ולתפעל מערכות יחסים בין קבוצות של גנים. עם הדמיה גן ברורה יותר, קל יותר לחוקר לזהות שימור synteny בין הגנום מרובה.  Syntainia הוא יישום שולחן עבודה שנראה...

checkmyclones הוא תוכנה המספקת כלים כדי לבדוק תוצאות סנגר רצף & nbsp;. (או כל טקסט רגיל או קבצי FASTQ) נגד קבוצה של רצפי התייחסות, ובלבד בכל פורמט סביר (כולל קואורדינטות) דרישות : ...

tigreBrowser הוא דפדפן מודל ביטוי גנים לתוצאות מחבילת R טיגרה (http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/tigre.html). התקנה: tigreBrowser דורש גרסת פייתון> = 2.5. ניתן להתקין tigreBrowser עם הפקודה הבאה:פיתון setup.py להתקיןלקבלת מידע נוסף על...

picme היא חבילת פייתון המכילה תוכניות להעריך ולתכנן האינפורמטיביות פילוגנטי למערכי נתונים גדולים. התקנה לרגע, הדרך הקלה ביותר כדי להתקין את התכנית היא:git git שיבוט: //github.com/faircloth-lab/picme.git / נתיב / ל / picmeכדי להפעיל בדיקות:cd / נתיב / ל /...

טפיר הוא כלי פייתון המכיל תוכניות להעריך ולתכנן האינפורמטיביות פילוגנטי למערכי נתונים גדולים.טפיר מצטט בעת השימוש בטפיר, נא לציין:- Faircloth לפנה"ס, צ'אנג J, אלפארו ME: טפיר מאפשר ניתוח תפוקה גבוה של האינפורמטיביות פילוגנטי.- טאונסנד JP: אפיון...