צילום מסך תוכנה:
פרטי תוכנה:
צעדים הוא חבילת סימולציה סטוכסטיים מדויקת של מערכות התגובה-דיפוזיה בגיאומטריות מורכבות 3D באופן שרירותי. אלגוריתם הסימולציה ליבה שלנו הוא יישום של SSA של גילספי, הרחיב להתמודד עם דיפוזיה של מולקולות על פני האלמנטים של רשת tetrahedral 3D.
למרות שזה פותח בעיקר להדמיית מודלים מפורטים של מסלולי איתות עצביים בדנדריטים וסינפסות סביב, זה הוא כלי כללי ויכול לשמש ללימוד כל מסלול ביוכימי שבו הדרגתיים וצורה מרחבית הם חשבו לשחק תפקיד.
יישמנו צעדים כמערכת של מודולים Python, מה שאומר שמשתמשים יכולים להשתמש בצעדי תסריטי פייתון לשלוט בכל ההיבטים של הקמת המודל, יצירת רשת, שליטה הסימולציה וההפקה וניתוח פלט. השגרה חישובית הליבה עדיין מיושמת כמודולים סיומת ++ C / C למהירות מקסימלי של ביצוע.
. צעדים מופץ תחת רישיון GPL v3
דרישות :
- Python
תגובות לא נמצא