הטוב ביותר ביואינפורמטיקה עבור Linux

פרויקט VULCAN מספק ניתוח דינמיקה של נוזלים חישובית.VULCAN (הצמיג נגד רוח אלגוריתם לזרימת ניתוח מורכב) מציע דינמיקה של נוזלים חישובית למהירות תת-קולית דרך סוער קולי מגיב ולא מגיב תזרים על מגוון רחב של פלטפורמות חישובית סידוריים ומקבילות.העלות החישובית של...

Murka הוא חוצה פלטפורמה חופשית, ותוכנה של שורת הפקודה הקוד הפתוח שמסייעת למשתמשים לפתור בקלות את הבעיה תולדות הגזע, פשוט באמצעות רשתות חציון. הוא כולל שיטות האוריסטי, אלגוריתמים מדויקים, כמו גם פותר בעיות שטיינר.Murka & rsquo; הקלט של מספק הפיך...

צעדים הוא חבילת סימולציה סטוכסטיים מדויקת של מערכות התגובה-דיפוזיה בגיאומטריות מורכבות 3D באופן שרירותי. אלגוריתם הסימולציה ליבה שלנו הוא יישום של SSA של גילספי, הרחיב להתמודד עם דיפוזיה של מולקולות על פני האלמנטים של רשת tetrahedral 3D.למרות שזה פותח...

קפסיד הוא פלטפורמה מקיפה קוד פתוח המשלבת צינור חישובית ביצועים גבוהים עבור רצף הפתוגן זיהוי & nbsp; ואפיון בהגנום וtranscriptomes אנושיים יחד עם מסד נתונים תוצאות מדרגי ומבוסס אינטרנט יישום תוכנה ידידותי למשתמש לניהול, ביצוע שאילתות באופן חזותי תוצאות....

אררו הוא מבוסס על MACS (דגם ניתוח מבוסס על נתונים שבב Seq).רצף תפוקה גבוהה מצמידים את המשקעים חיסוניים הכרומטין (שבב Seq) נמצא בשימוש נרחב באפיון הגנום דפוסים מחייבים של גורמי שעתוק, קו-פקטורים, מכפילי הכרומטין, וחלבוני DNA מחייב אחרים. צעד מפתח בניתוח...

Syntainia הוא יישום חדשני להדמיה של הגנום מרובה & nbsp;. הוא מציג ממשק משתמש פשוט ואינטואיטיבי להציג ולתפעל מערכות יחסים בין קבוצות של גנים. עם הדמיה גן ברורה יותר, קל יותר לחוקר לזהות שימור synteny בין הגנום מרובה.  Syntainia הוא יישום שולחן עבודה שנראה...

אוךתנק הוא מקור חופשי לגמרי, פתוח, פשוט, קל משקל, אך רב עוצמה DICOM העצמאי נינוחה (Digital Imaging והתקשורת ברפואה) שרת שניתן להשתמש בסביבות בריאות ומחקר רפואי. & rsquo;. תוכנה של שורת הפקודה sa מיושם ב- C ++ ומהונדס באופן כזה שהוא יכול בקלות להפוך את...

כבול הוא חבילה של תוכניות ללכידה, חיזוי וניתוח מאפייני biophysical של חלבונים.ראה http://enzyme.ucd.ie/PEAT לתיעוד, הוראות, צילומי מסך וכו ' דרישות :. ...

LSim superposes צפיפות אלקטרונים macromolecular ומחשב ציון דמיון מבני. החישובים שלה בקנה מידה באופן ליניארי עם הגודל של המולקולות מושווים.יישור LSim הוא מושגית שאינו קשור לאלמנטים מבניים ביוכימיים, ולכן, אינם מוטים ומתאימים ללימודי דמיון חלבון מבנה...

TRMiner הוא כלי Python שמטרתה אוצרי נתונים מדעיים & nbsp;. היא מאפשרת לגזום במהירות אוסף גדולה של פרסומים מדעיים למשפטים רלוונטיים למטרת כרייה נתון.זו מושגת בשני שלבים. ראשית, טקסטים tranlated לרצפים של אסימונים למילים רלוונטיות. שנית, דפוסי ביטוי רגילים...