הטוב ביותר ביואינפורמטיקה עבור Linux

NetAtlas הוא תוסף Cytoscape שמשתמש בנתוני ביטוי גנים ברקמות כדי לסנן רשת איתות תאית. NetAtlas מזהה רשתות מוגדרות רקמה, רכיבי רשת רקמות ספציפיות, ורכיבים עם ביטוי מתואם על פני...

CLC רצף Viewer יוצר סביבת תוכנה המאפשרת למשתמשים לבצע ביואינפורמטיקה הבסיסית ניתוחים וניהול נתונים חלקים, בשילוב עם אפשרויות צפייה ופלט גרפיות מצוינות.הנה כמה תכונות עיקריות של "CLC Workbench חינם":- GenBank חיפוש והצגה (ליניארי ונוף מעגלי)- יישור מרובה...

חותם הוא מודול פייתון שמספק יישור רצף על Hadoop.חותם הוא יישום של MapReduce יישור רצף ביולוגי. היא פועלת על Hadoop (http://hadoop.apache.org) דרך Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), API Python MapReduce וHDFS לHadoop. דרישות : ...

biotools היא חבורה של ביואינפורמטיקה כלי עזר נכתב בפייתון דרישות :. ...

Pysam הוא מודול פייתון לקריאה ולמניפולצית Samfiles & nbsp;. זה עטיפה קלה של C-API samtools.המדריך להתחלה מהירה היא כאן. תיעוד מפורט יותר זמין כאן.שאלות והערות תתקבלנה בברכה, ויש לשלוח לקבוצת המשתמשים pysam...

. HTSeq היא מסגרת פייתון לעבד ולנתח נתונים מרצף תפוקה גבוהה (HTS) מבחני דרישות : < li>...

checkmyclones הוא תוכנה המספקת כלים כדי לבדוק תוצאות סנגר רצף & nbsp;. (או כל טקסט רגיל או קבצי FASTQ) נגד קבוצה של רצפי התייחסות, ובלבד בכל פורמט סביר (כולל קואורדינטות) דרישות : ...

מתכנן RFLP הוא כלי שעוזר לתכנן ניסוי RFLP: הוא מוצא אנזימי הגבלה, כי לחתוך קבוצה של רצפי DNA homologue בדרכים שונות ומדמה את תמונת אלקטרופורזה ג'ל וכתוצאה מכך. התכנית מסייעת לך למצוא את אנזימי הגבלה החיוניים המאפיינים את האוכלוסייה. עם הסימולציה...

CodonW היא תכנית שנועדה לפשט את הניתוח רב משתני (ניתוח התכתבות) של שימוש בחומצת אמינו וקודון. הוא גם מחשב מדדים סטנדרטיים של שימוש קודון. יש לו שני תפריט וממשקי שורת הפקודה.פרויקט CodonW נכתב על ידי ג'ון Peden במעבדה של פול שארפ, מחלקה לגנטיקה,...

פרויקט Adun היא תכנית סימולציה biomolecular להרחבה, הכוללת יכולות ניהול נתונים וניתוח.Adun מספק אלגוריתמים מתקדמים ופרוטוקולים לסימולציה מולקולרית אשר ניתן לגשת מממשק משתמש אינטואיטיבי, אלא גם מרמה תכנותית לגמישה יותר. היא בנויה על מסגרת Adun שהיא ספרייה...