MACS2 הוא כלי ניתוח מודל המבוסס על נתונים שבב Seq.
עם השיפור של טכניקות רצף, immunoprecipitation הכרומטין ואחריו רצף תפוקה גבוה (שבב Seq) הוא מקבל פופולרי ללמוד אינטראקציות החלבון-DNA הגנום. כדי לטפל בחוסר שיטת ניתוח שבב Seq החזק, אנו מציגים אלגוריתם רומן, בשם ניתוח של שבב Seq (MACS) המבוסס על דגם, לזיהוי גורם תמליל אתרי קישור. MACS לוכד את ההשפעה של מורכבות הגנום כדי להעריך את המשמעות של אזורי שבב מועשרים, וMACS משפר את הרזולוציה מרחבית של אתרי קישור באמצעות שילוב המידע משתי עמדת תג רצף וכיוון. . MACS יכול לשמש בקלות לנתונים שבב Seq לבד, או עם מדגם שליטה עם הגידול של סגוליות
דרישות :
- > Python
תגובות לא נמצא