Ghemical היא חבילת תוכנת כימיה חישובית שוחררה תחת GNU GPL. זה אומר שהקוד מקור מלא של החבילה הוא זמין, והמשתמשים חופשיים ללמוד ולשנות את החבילה. Ghemical כתוב ב- C ++.
יש פרויקט Ghemical ממשק משתמש גרפי (המבוסס על GNOME), והוא תומך בשני הקוונטים-מכניקה (חצי-אמפירי ומלכתחילה) דגמים ומודלי מכניקה מולקולריים (יש שדה ניסויי Tripos 5.2 כמו-כוח לmolecu אורגני כמו כן כלי למודלים חלבון מופחת [1] כלול. אופטימיזציה גיאומטריה, דינמיקה מולקולרית וקבוצה גדולה של כלים להדמיה זמינים כרגע.
Ghemical מסתמך על קוד חיצוני כדי לספק את החישובים קוונטיים-מכאנית. שיטות למחצה אמפיריות MNDO, Mindo / 3, AM1 וPM3 מגיעים מחבילת MOPAC7 (Public Domain), ונכללות בהפצת המקור.
חבילת MPQC (GNU GPL) משמשת כדי לספק מלכתחילה שיטות: השיטות המבוססות על תיאורית Hartree-Fock כיום נתמכות עם ערכות בסיס החל STO-3G ל6-31G **.
קוד MPQC אינו כלול בהפצת המקור. על מנת להשתמש בab מבוסס MPQC initio השיטות בGhemical, תחילה עליך לקמפל ולהתקין את תכנית MPQC למערכת שלך, ולאחר מכן לאסוף Ghemical באמצעות כמה הגדרות ספציפיות המקשרים התוכניות יחד; לראות את קובץ התקנה למידע נוסף. Ghemical מכיל גם את חבילת OpenBabel ליבוא ויצוא של פורמטים של קבצים שונים (כמו גם משימות אחרות).
התקנה
לאחר שהורדת את המהדורה האחרונה, אתה צריך לחלץ את כל הקבצים מקובץ הארכיון שלך באמצעות "זפת -zxvvf ghemical-1.00.tgz" או באופן שקול "gunzip ghemical-1.00.tgz; זפת -xvvf ghemical-1.00.tar". לאחר שקרא את "התקן" -file אתה פשוט חילוץ כדי לקבל מידע נוסף.
מה חדש במהדורה זו:
תגובות לא נמצא