CaPSID

צילום מסך תוכנה:
CaPSID
פרטי תוכנה:
גרסה: 1.4.3
טען תאריך: 20 Feb 15
מפתחים: Shane Wilson
רשיון: ללא תשלום
פופולריות: 28

Rating: nan/5 (Total Votes: 0)

קפסיד הוא פלטפורמה מקיפה קוד פתוח המשלבת צינור חישובית ביצועים גבוהים עבור רצף הפתוגן זיהוי & nbsp; ואפיון בהגנום וtranscriptomes אנושיים יחד עם מסד נתונים תוצאות מדרגי ומבוסס אינטרנט יישום תוכנה ידידותי למשתמש לניהול, ביצוע שאילתות באופן חזותי תוצאות.
תחילת עבודה
אתה צריך מסד נתוני MongoDB, התקנת 2.6+ Python וApache Tomcat 6 +. לפרטים נוספים, קרא את wiki:
http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

What הוא חדש במהדורה זו:

    • תיקונים הודעת שגיאה בעת הפעלת חיסור ויישור לא נמצאה
    • עוד עבודה על תיקון שאילתות ריצה ארוכות

    מה חדש בגרסת 1.4.2:

    • הסרת תלות
    • MongoKit

    מה חדש בגרסת 1.4.1:

    • פסק זמן סמן תיקונים עבור שאילתות סטטיסטיקת ריצה ארוכות

    מה חדש בגרסת 1.4.0:

    • סטטיסטיקה מוסיף בזמן שהם מתנהלים ולא את כל בסוף
    • חוסך id הייחודי לגנים כuid

    מה חדש בגרסת 1.2.7:

    • תיקוני README

    מה חדש בגרסת 1.2.6:

    • החיסור מסנן את ממופה בעת הבנייה ממופה הקורא

    מה חדש בגרסה 1.2:

    • שירות כדי ליצור קבצי FastQ מממופים קורא
    • Utility לחזור צומת של קבצי FastQ
    • Utility כדי להחזיר את קבצי FastQ המסנן
    • דגל סף mapq נוסף לחיסור
    • Gbloader יכול כעת לטעון חיידקים ופטריות הגנום
    • חוסך רצפי גנום למסד נתונים באמצעות GridFS
    • טביעת רגל זיכרון מופחתת כאשר נתוני חישוב
    • subprocesses שימוש במקום os.system

    • מסנן
    • ציוני mapq צריך לכלול 0

    מה חדש בגרסת 1.1:

    • מוסיף תמיכה לצמד-הסוף קוראת

    מה חדש בגרסת 1.0.1:

    • תמיכה נוסף לאימות MongoDB

    דרישות :

    • Python

  • תוכנה דומה

    Adun
    Adun

    3 Jun 15

    Ghemical
    Ghemical

    3 Jun 15

    Murka
    Murka

    14 Apr 15

    VULCAN
    VULCAN

    20 Feb 15

    תגובות ל CaPSID

    תגובות לא נמצא
    להוסיף הערה
    הפעל את התמונות!