Open בבל הוא קוד פתוח, תוכנה, ספרייה שיתופית חופשית ומרובה שתוכננה לפעול כארגז כלים כימיים שתוכננו במיוחד כדי לזהות שפות רבות של נתונים כימיים. זה פשוט מכונה & ldquo; להרחיב הכימיה Toolkit & rdquo;. תכונות בglanceWith להרחיב בבל, משתמשים יוכלו לחפש, לנתח, להמיר, ולאחסן נתונים מכימיה, הדמיה מולקולרית, ביוכימיה, כמו גם באזורים אחרים בנושא. הוא תומך במגוון רחב של פורמטים של קבצים כימיים נפוצים, כוללים Mol2, SDF / MOL, PDB, XYZ, חיוכים, וCML.
בנוסף, להרחיב בבל מספק תמיכת ערכת הכלים, MIME הכימי של מתכנת בהשתתפות מלא, חוכמת matcher, אטום גמיש / קשר typer, מחיקת מימן ובנוסף, bitvector כיתה, תמורות מטריצה ווקטור, כמו גם suite.Under בדיקה מולקולרית למכסה המנוע ו נתמך systemsOpen בבל הפעלה כתוב כולו בשפת תכנות C ++. זה & rsquo; sa תוכנה בפלטפורמות אמיתית שתומכת גנו / לינוקס, BSD, Solaris, SGI, Microsoft Windows ומערכות הפעלה Mac OS X. שני מחשבי 32 סיביות ו -64 סיביות נתמכים באופן רשמי בעת כתיבת this.Getting התחילה עם Open BabelFirst כל, אנחנו מאוד ממליצים לך להתקין להרחיב בבל על ידי שימוש בחבילות בינאריות שנבנו מראש ממאגרי תוכנת ברירת מחדל שלך הפצת לינוקס. אם מערכת GNU / Linux שלך אינה & rsquo; לא צריך התוכנה להרחיב בבל בrepos, אז אתה & rsquo; ll צריך לקמפל והתקנת היישום באמצעות המקורות האוניברסליים ארכיון הניתן בSoftoware.
הורד את tarball (ארכיון tar.gz), לחלץ אותו במיקום על פי בחירתך, לפתוח מסוף אמולטור, לנווט לתיקייה שחולצה ולבצע & ldquo;. Cmake & rdquo; הפקודה (ללא מרכאות) כדי להגדיר את הפרויקט. לאחר מכן, עליך להפעיל את & ldquo; לעשות & rdquo; הפקודה, ללא מרכאות, כמובן, לקמפל אותו. אנא ודא שכלי CMake במותקן במערכת ההפעלה שלך לפני את ההוראות לעיל
מה חדש בהודעה זו :.
- שחרור זה מייצג תיקוני באגים שחרור גדול וצריך להיות שדרוג יציב, מומלץ בחום לכל המשתמשים של Open בבל. הרבה באגים ושיפורים שנוספו בשנה האחרונה מאז השחרור 2.3.0.
מה חדש בגרסת 2.2.2:
- שחרור זה מייצג שחרור תיקוני באגים משמעותי ו הוא שדרוג יציב, מומלץ בחום לכל המשתמשים של Open בבל. אמנם יש לא יכול להיות הרבה תכונות חדשות, רבות קריסות ובאגים אחרים תוקנו מאז 2.2.1.
- משודרג לשחרור InChI 1.02 החדש כדי לייצר תפוקת InChI וInChIKey סטנדרטית.
- קבוע שגיאות סטראוכימיה רבות בעת קריאה / כתיבת חיוכים. זה הוא חלק מפרויקט גדול יותר שיהיה סיים בשחרור 2.3.
- אוסף קבוע והתקנה על פלטפורמות Cygwin וMinGW.
- ארומטיות השתפרו באופן משמעותי וקקולה אג"ח משימה.
- 2D משופר - & gt; 3D לתאם דור
- משופרים לתאם דור באמצעות הפעולה של שורת הפקודה --gen3d
- ביצועים משופרים לתיאום דור.
- החדש --fillUC לבבל.
- תיקונים לתוספת מימן pH תלוי.
- תמיכה נוסף לקריאת נתונים רטט מMolden, Molpro, וNWChem קבצי פלט.
- רדיוסים אטומיים עודכן בחישובים תיאורטיים אחרונים.
- תוקן הבאג בעת קריאת קבצי Mol2 או XML-דחוס gzip.
- קבצים לסגור אחרי שגיאה. מתקן באג עם Pybel בו קבצים יישארו פתוחים.
- תיקוני באגים רבים יותר ושיפורי תכונה קטנים. == תבניות קבצים חדשים == יבוא ויצוא:
- קלט ופלט Molpro.
- VASP לתאם (CONTCAR וPOSCAR).
פעולת שורת הפקודה
קבצים
מה חדש בגרסת 2.2.1:
- ממשקי scripting משופרים, כולל Python 3 תמיכה והשתפר תמיכה # Java ו- C.
תגובות לא נמצא