Marvin

• MarvinSketch:
• חיפוש באתר ציבורי בchemicalize.org.
• אפשרות לשנות את סדר יגנד בMarvinSketch.
• ערפל-ההשפעה יכולה להיות נשלט בדרכים שונות:
• יש מחוון בכרטיסיית התצוגה של הדו-שיח העדפות בסקיצה / צפה בGUI כדי להגדיר את כוחו של הערפל-ההשפעה ותיבת סימון כדי לכבות את הערפל-ההשפעה האוטומטית.

פרמטרים
• יישומון ושעועית הם הציגו: fogFactor, automaticFogEnabled. (פורום בנושא).
• חיבור לנקודת חיבור קבוצה לא באופן אוטומטי ungroup Sgroup יותר.
• קביעת תוכן S-קבוצה:. S-קבוצות רבות וגנריים צריכים להכיל את כל subgraph בין איגרות החוב שחצו את סוגריים
• עדכון של תוכן S-קבוצה אם עמדות הסוגר לשנות: או סוגריים או המבנה עברו
.
• הטבעת S-קבוצה וחפיפה נבדקות בבדיקות עקביות מולקולה.
• חוכמת יבוא תומך פחמנים אליפטי עם קשר כפול (נושא פורום).
• חיוכי יבוא / יצוא תומך allenes.
• צור שם מסורתי לברים בתוך מתחם גדול יותר (לדוגמא & quot; dextromethorphan hydrobromide & quot;).
• תמיכה עבור המרת מספר CAS.
• .
תיקון שגיאות OCR משופר בDocumentExtractor (פסיקים חסרים, סוג misrecognized סוגריים, רווחים מיותרים, ...)
• מסמך Extractor על מסמכי PDF עכשיו נותן את מספר העמוד של להיטים.
• תמיכה משופרת עבור שמות נפוצים במבנה לשם ושם למבנה. התמיכה הכללית לשם יבוא גדלה בשיעור של כ -5% לנפוצים ו- 10% לשמות שיטתיים. מהירות המרה היא גדלה בכ -20%.

מתקיני שעועית
• JChem ומרווין עבור Windows גם לחלץ תסריט פגז לCygwin.
• שמור על קבוצות exocycyclic במסגרות Bemis-Murcko.
• הלוגן יכול להיות יותר מחיבור אחד בספירה.
• אג"ח ארומטי נחשב בחישוב מספר הקשרים כפולים לבדיקת רכוש הומולוגיה.
• מצב בחירה לאסו יכול להיות מוגדר כברירת המחדל בMSketchPane (נושא פורום).
• פונקציה חדשה, isChiral נוספה TopologyAnalyzer.
• פונקציות חדשות Chmical תנאים: isQuery (), fieldAsString ()
.
• תיקוני באגים:
• התיבה שם לא עודכנה לאחר הקמת הקבוצה כי יצירת קבוצה לא להגדיל את ספירת גרף משתנה שינוי (נושא פורום).
• יישום MarvinSketch לא הבין & quot; - {name} & quot; פרמטר של שורת הפקודה.
• כאשר המבנה & gt; מצא את מבנה תפריט מקוון הופעל תחת לינוקס, דפדפן ברירת המחדל לא יכול להיות מזוהה לתצוגת תוצאה (נושא פורום).
• הטעינה של קובץ isotopes.data ממטמון java נכשלה אם הגרסה דחוסה שלה אוחסנה במטמון (כלומר, אם ביטול הדחיסה נעשה באופן אוטומטי על ידי שרת האינטרנט, ולא על ידי מרווין). נושא פורום, תיעוד.
• אובייקטים גרפיים שאינם מוצג בחלון תוצאת הגיאומטריה Plugin.
• באלקטרון-זרימת החץ, הקופסה הכחולה להדגשה הוחמצה (נושא פורום).
• כדי יגנד לא מוצג על הפיגום אם ההגדרות נמחקו, גם אם & quot; תמיד & quot; אפשרות תצוגה נקבעה ל& quot; הזמנות & quot יגנד; על הדו-שיח ההעדפות.
• האינדקס של אטום הרב-מרכזי הפך מושחת לאחר היצוא לפורמט MDL מול אם זה היה קשור לR-קבוצה.
• חץ תקוע למלבנים נפגע ביבוא / יצוא (נושא פורום) MRV.
• יבוא של פפטיד 1-המכתב נכשל בהיסטידין אחד (נושא פורום).
• מימנים סמויים היו חסרים על ידי יבוא מSKC.
• ערך נכס ריק של MolAtom לא ייצא / מיובאים בפורמט MRV.
• לפי יבוא החוכמה מסוימת, בסדר אג"ח הסוג נקבע במקום אג"ח בודד או ריחני.
• סוגריים מסוימים מיובאים מקבצי CDX נמשכים בChemDraw הוצגו בכיוון הלא נכון.
• חוכמת יצוא:. 1-אטום השכן קשר יחיד של טבעת ארומטית היה מיוצא כקשר יחיד במקום יחיד
/ ארומטי
• יצוא שאילתות עם קישור צומת וR-קבוצות בפורמט החוכמה היה שגוי.
• טיפול אטום H היה דו-משמעי בביטויי החוכמה.
• יבוא שדה הערות קובץ מול נכשל.
• יבוא של חיוכים מסוימים היה (נושא פורום) הלא נכון.
• אם התבנית מכילה חלק שרשרת אשר יכול להיות ממוקם ביעד כחלק מ( או מערכת טבעת) טבעת עלינו להתעלם מחלק זה של התבנית.
• פיין עם Hydrogenize האפשרות של Clean3D לא ungroup S-קבוצות באופן אוטומטי (נושא פורום).

Molecule.contractSgroups
• () פישל קואורדינטות המולקולה (פורום בנושא).
• מימנים מפורשים לא נלקחו כראוי בחשבון בחישוב סטראוכימיה הסיס / Trans.
• גנרטור Tautomer זרק ArrayIndexOutOfBoundsException במקרים מסוימים.
• ספירת הומולוגיה מיוצרת מולקולות עולות בקנה אחד לכמה קלט VMN.
• תשלום שגוי לספור לאחר החלת סדר CovalentCounterion.
• תבנית פלט היומן של שורת פקודת StructureChecker שונה מפלט בפורמט של האשף.
• ChiralFlagErrorChecker לא טפל כראוי כירליות. במקום חישוב כירליות מנתוני זוגיות, זה היה יישום המבוסס על שיטת isChiral של TopologyAnalyser.

מה חדש ב5.4.0.1:

• Highlighting גרסה של זרימת אלקטרונים חצים טעה כאשר הבסיס או נקודת סיום הייתה קשר (נושא פורום).
• תצורת תפריט מספר סידורית לא עבדה.
• המדד של אטום הרב-מרכזי נוצר באופן שגוי במהלך יצוא MDL MOLFile במקרה של מבנים שבם R-הקבוצה הייתה קשורה לאטום הרב-מרכזי (אג"ח וריאציה עמדה).
• מימנים סמויים היו חסרים מהאטומים לאחר היבוא או הדבק של מבנים ב/ Symyx פורמט קובץ סקיצה (פורמט קובץ SKC) ISIS.
• קבצי CDX כוללים אובייקטים גרפיים מסובבים מיוצאים מגרסאות ישנות של ChemDraw לא ניתן לייבא.
• חישוב Tautomer
• tautomer Generic לא היה ייחודי מספיק בחלק ממקרים. בשל התיקון, tautomer הגנרית מסופק צורה ארומטיים.
• חישוב tautomer Canoncical שופר עקב התיקון של dearomatization.
• מבנים מסוימים עם מימנים מפורשים הקשורים בקשר טריז נתנו חריג במהלך tautomerization גנריות.
• חישוב נפח היה חסר cxcalc.
• מבנה בודק זרק NullPointerException במקום להתעלם מקובץ הגדרות שגוי.

מה חדש בגרסת יבוא 5.1.03.2:

• IUPAC שם: המרת שמות IUPAC למבנים.
• OLE 2 תמיכה:. תמיכה משופרת של הדבקת MarvinSketch חפץ לתוך מסמכי MS Office
• תנאים כימיים:. זמינים ממרווין בשורת הפקודה, API וניתן להשתמש בם בתסריטי Java (ביישומוני)
• מואץ אתחול של MarvinSketch וMarvinView בעת ההפעלה, הן כגרסה עצמאית, וכמרכיב מיושם ביישומים אחרים.

דרישות :

• Java 2 Standard Edition Runtime Environment