פרופיל mRNA הגנום מספק תמונת מצב של המדינה הגלובלית של תאים בתנאים שונים. עם זאת, רמות ה- mRNA לא מספקות הבנה ישירה של מנגנוני רגולציה במעלה הזרם. Expression2Kinases (X2K) היא גישה חדשה לזיהוי רגולטורים במעלה הזרם סביר באחריות לשינויים שנצפו בביטוי הגנום גן. על ידי שילוב של שבב seq / שבב ועמדת משקל מטריצות (PWMs) נתונים, אינטראקציות בין חלבונים, ותגובות זירחון קינאז-מצע X2K יכול לשמש כדי לזהות מנגנוני רגולציה במעלה הזרם של הבדלי הגנום בביטוי גנים. הרעיון הוא ראשון להסיק גורמי שעתוק הסביר ביותר המסדירים את ההבדלים בביטוי גנים, ולאחר מכן להשתמש אינטראקציות חלבון-חלבון להתחבר גורמי שעתוק המזוהים באמצעות חלבונים נוספים לבניית רשתות משנה רגולציה תעתיק התמקדו בגורמים אלה, ולבסוף להשתמש קינאז-מצע תגובות זרחון חלבון, לזהות וחלבון-קינאז מועמד דרגה שסביר להניח שמסדיר את הקמתה של מתחמי תעתיק המזוהים. X2K מכיל גם כלים כדי לבצע רשימה-גן העשרת ניתוחים ולחזות תרופות שיכולים להפוך או להחמיר שינויים בביטוי גנים. . גישת X2K יכולה לקדם את ההבנה של איתות תא שלנו ולפענח מנגנוני סמים פעולה
דרישות :
Java Runtime Environment 6.0
תגובות לא נמצא