PathVisio הוא קוד פתוח ויישום גרפי לגמרי בחינם מיושם בשפת תכנות ג'אווה ותוכנן מהיסוד כדי לשמש להצגה, ניתוח ועריכת מסלולים ביולוגיים תחת הפעלה GNU / Linux system.Can לשמש לצייר מסלולים , לקשר תוכנת entitiesThe ביולוגית מאפשרת למשתמשים לצייר מסלולים, לקשר ישויות ביולוגיות (חלבונים או גנים) לנתונים ביולוגיים, באמצעות מזהי מסד נתונים, מסלולים לערוך, כמו גם לנתח מסלולים. עם PathVisio אתה גם תוכל למפות נתונים ניסיוניים, כגון נתונים microarray, ולדמיין אותו על גבי ציור המסלול הקיים.
בנוסף, תוכל לבחור מסד נתונים גן, בחר במסד נתונים מטבולים, להציג נתונים סטטיסטיים, נתונים ביטוי יבוא, מערך ביטוי בחר, מסלולי חיפוש, אגדת נוף, לטפל באובייקטים, פרויקטי יבוא, כמו גם להתקין ולנהל תוספים, אשר יכול להוסיף פונקציונליות נוספת לapp.Requires אין יישום installationThe ניתן להשתמש ללא התקנתו במערכת ההפעלה גנו / לינוקס שלך. כל מה שאתה צריך לעשות הוא להוריד את החבילה בינארי מSoftoware, לשמור את הארכיון על מיקום של הבחירה שלך, לחלץ אותו באמצעות כלי מנהל ארכיון, לפתוח את הספרייה שחולצה, ולחץ לחיצה כפולה על pathvisio.jar file.Under hoodWhile לוקח מבט מהיר מתחת למכסת המנוע של תוכנת PathVisio, אנחנו & rsquo; שמו לב שהיישום כתוב כולו בשפת תכנות ג'אווה, ושממשק המשתמש הגרפי שלה נועד עם טכנולוגיות Java סווינג האחרונות. אנחנו & rsquo; ve בדק את היישום במחשבים התומכים באחת מarchitectures.Runs המעבד 32 או 64 סיביות בכל מערכת הפעלה שבי Java הוא supportedBeing נכתב בשפת תכנות ג'אווה בהצלחה, אפשר להכריז PathVisio יישום פלטפורמה עצמאית שתומך גנו / לינוקס , Microsoft Windows, Mac OS X, BSD, Solaris, וכל מערכת הפעלה אחרת שבו טכנולוגיות Java האחרונות נתמכות
מה חדש במהדורה זו:.
- 31 ינואר 2014: שחרור תיקון באג
- מונחי GeneOntology עכשיו יוסרו מתוצאות חיפוש עבור הסברים
- DataNodes צריך להיות מבואר עם תעודת זהות ומקור נתונים או כלום (חיסכון בצומת נתונים עם תעודת זהות בלבד או בנתוני מקור אינו מותר עוד)
מה חדש בגרסת 3.1.2:
- באג מרכזי במודול יבוא קובץ הקבוע: http: //developers.pathvisio.org/ticket/1697
מה חדש בגרסה 2.0.11:
- שמירה אוטומטית
- זום גלגל גלילה באמצעות
- הבחירה של קווים קלה יותר: אין עוד צורך ללחוץ על פיקסל המדויק
- כעת, עם שתי שיטות לניתוח ייצוג יתר; אוריינטציה מסלול אחד ו מוכוונת נתונים אחד
מה חדש בגרסה 2.0.10: אפקט
- דרך חדשה של ציור מעוגלת מלבנים כדי למנוע מתיחה
מה חדש בגרסת 2.0.9:
- סוג המחבר חדש למחבר של אורך ושרירותי שרירותיים זוויות
מה חדש בגרסה 2.0.8:
- צורות משופרות למרכיבים תאיים
- כמה שיפורי שימושיות כמו העתק / דבק בתפריט הקופץ
- לראות אבן דרך: & quot; milestone_26 & quot; לרשימה של באגים-תיקונים מלאים
מה חדשים בגרסת 2.0.7:
- סמלי סרגל כלים וצד פנל חדש כדי להקל כדי לבחור סוגי חץ וצורות (liubing תודה)
- מסדי נתונים נתיב כלולים כמקור הנתונים, כך שאתה יכול להוסיף קישורים ממסלול אחד למשנהו
- BioPAX ממיר שופר ומייצר מסמכי BioPAX תקפים יותר.
- סוג המחבר החדש שבו ניתן להשפיע על נקודות בודדות (leonth תודה)
- מספר מקורות נתונים כבר עלה ליותר מ 180
- לראות אבן דרך: & quot; milestone_25 & quot; לרשימה של באגים-תיקונים מלאים
מה חדש בגרסת 2.0.6:
- מספר העוגנים בצורה יכול להיות מוגבר מברירת המחדל 12.
מה חדש בגרסת 2.0.4:
- שיפור עיצוב טקסט של צורות, תוויות וdatanodes
- רבות יותר צורות לdatanodes
- קואורדינטות פיקסל פשוט
- צבע רקע להגדיר בdatanodes
מה חדש בגרסת 2.0.3:
- הבולט ביותר בגרסה זו היא סכימת XML החדשה לפורמט מסלול GPML (2010a גרסה). פורמט המסלול החדש יאפשר לרבי יכולות גרפיות חדשות בעתיד, אתה יכול לצפות לכמה מאלה המופיעים במהדורה הבאה.
- מאפיינים חדשים נוספים:
- עוגני Invisible באמת בלתי נראה, לפחות כאשר משהו שקשור אליהם (תודה למרגוט)
- אפשרות שורת פקודת -v במיוחד (הודות למארק)
- מסד נתונים שבחר כעת מוצג כראוי בשורת המצב שוב
- נקודות סיומת חדשות רבות עבור מפתחי תוסף
- לראות אבן דרך: & quot; milestone_21 & quot; לרשימה של באגים-תיקונים מלאים
מה חדש בגרסת 2.0.1:
- אלגוריתם משופר למחברים אוטומטיים המצביעים על עוגן .
דרישות :
- Oracle Java Standard Edition Runtime Environment
תגובות לא נמצא