התכנית היא הצופה לקבצי PDB-התקן והדמית 3D של מבני Atom הכלולים.
מספר קבצים באותו הזמן יכולים להיות פתוחים ומוצגים בצורה הטובה ביותר על המסך.
מבנה Atom מאתר בשתי דרכים:
כעץ הדגם - שרשרת - שאריות - Atom, ובם "אטומים Het" (מאז גרסת 2009.2.20.3). "Het Atom", שאריות, שרשרת ודגם כלול "אטומים Het" נבחרו על ידי הגופן של צבע אדום.
גופן מודגש מראה שיש אטום מאבקים אלה כבר קיבלו מסעיף CONECT (מאז גרסת 2009.3.20.4).
כסצנת 3D של אובייקטים שנבחרו.
מודל אחד או שרשרת אחת או רשימה של שאריות ניתן לבחור בעץ ובחירה זו תוכלו לראות בסצנה. שאריות ניתן לבחור בדרך רגילה של Windows באמצעות עכבר עזב קליקים מפתח עם Shift או מקשי Ctrl במקלדת. רק שאריות של אותו הדגם יכולות להיות רב שנבחרו.
Atom נבחרים מוצג ב3D-סצנה עם השאריות בבעלות אטום.
אם Atom הנבחרות התחבר אטומים סצנת 3D מציגה את שאריות Atom הנבחרות וכל שאריות מחוברות (מאז גרסה 2009.3.20.4).
לחץ לחיצה כפולה על Atom כל בזירה תציג את Atom בעץ מבלי לשנות את בחירת העץ להכרה הטובה ביותר שלה.
שלושה כפתורים על "השרשרת" שליטת סצנת הפנל, "דוגמניות" ו- "שאריות" להראות את אובייקט ההקרנה הנוכחי ולעבור לאובייקט הורה מבלי לשנות את הבחירה בעץ.
הכפתורים "אטומים צבע" או "שאריות צבע" לשנות את הצבעים של אטומים בזירה.
הכפתורים "כל האטומים" או "N-CA-C" דרך השינוי 3D הקרנת שאריות - רק העיקרי N, CA ואטומי C או כל אלה.
שבעה הכפתורים "ראש", "למעלה", "למטה", "חזית", "חזרה", "שמאל", מתג "ימין" או לכבות את המנורות המתאימות בסצנה להקרנה הטובה ביותר. הכפתור הבורר "גלוי" או לכבות את הנראות של כל המנורות מלבד מנורות פנס שגלוי לעין כל הזמן כמו קובייה שקופה לבנה במרכז מערכת קואורדינטות.
תגובות לא נמצא