GENESIS (קיצור של מערכת סימולציה העצבית כללית) הוא פלטפורמת סימולציה למטרות כלליות שפותחה כדי לתמוך בסימולציה של מערכות עצביות הנעות בין רכיבי subcellular ותגובות ביוכימיות למודלים מורכבים של תאי עצב בודדים, סימולציות של רשתות גדולות, ומנגנונים של מודלים רמה.
GENESIS סיפק את הבסיס לקורסי מעבדה בסימולציה עצבית בקלטק, המעבדה לביולוגיה הימית, כרתים, טריאסטה, בנגלור, וקורסים קצרים אובידוס בחישוביות עצבית, ולפחות 49 אוניברסיטאות שאנו מודעים.
רוב יישומי GENESIS הנוכחיים כרוכים סימולציות ריאליסטיות של מערכות עצביות ביולוגיות. למרות שהתוכנה יכולה גם מודל רשתות מופשטות יותר, סימולטורים אחרים הם מתאימים יותר לbackpropagation ודוגמנות connectionist דומה.
התקנה
1. בחר את המקום שבו אתה רוצה להתקין את העץ "בראשית" בספרייה. אם אתה עושה התקנה מערכתית כמשתמש "שורש", / / usr המקומי הוא בחירה טובה. להתקנה אישית, ללא הרשאות root, אתה יכול להשתמש במדריך שלך הביתה ("~"). שינוי לספרייה זו ולחלץ את הספרייה בראשית מgenesis2.2.1-linux-bin.tar.gz קובץ ארכיון. למשל,
cd / usr / local
זפת xvzf /mnt/cdrom/genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz
או מכל מקום בו יש לך את זה (לדוגמא ~ / הורדות / genesis2.2.1-linux-bin.tar.gz).
2. שינוי לספרייה "בראשית" ולהפעיל את ההתקנה שיוצר קובץ אתחול GENESIS ".simrc" "התסריט. ואז להעתיק .simrc לתיקיית הבית שלך.
CD ראשית
./binsetup
.simrc cp ~
3. Finallly, להוסיף את הספרייה בראשית לנתיב החיפוש שלך, כך ש" בראשית "ניתן למצוא מכל ספרייה שאתה נמצא ב. אם פגז כניסה שלך הוא bash, אתה יכול לעשות זאת על ידי עריכת קובץ .bashrc בספריית הבית שלך להוסיף את השורה
PATH = $ PATH: / usr / local / בראשית
בסוף הקובץ. אם אתה משתמש בtcsh או csh כקליפת פקודתך, להוסיף
נתיב סט = (נתיב $ / usr / local / ראשית)
ל.tcsh או קובץ .csh.
בשלב זה, אתה מוכן לנסות לרוץ GENESIS. שינוי בראשית / סקריפטים ספרייה ולנסות כמה הדרכות הציעו בקובץ README
מה חדש בהודעה זו :.
- תיקוני באגים ושיפורים רבים.
תגובות לא נמצא