Gabedit

Gabedit הוא ממשק משתמש גרפי לגאוס, Molcas, Molpro וחבילות כימיה חישובית MPQC.
 
 Gabedit כולל מתקנים גרפיים ליצירת מילות מפתח ואפשרויות מפרטים מולקולה וחתכים קלט יס אפילו סוגים המתקדמים ביותר חישוב Gabedit כולל בניית מולקולה מתקדמת.
 
 אתה יכול להשתמש בו כדי לשרטט במהירות במולקולות ולבחון אותם בשלושה ממדים. אתה יכול לבנות מולקולות אחרות אטום, טבעת, קבוצה, חומצת אמינו ונוקלאוזידים. גם אתה יכול לקרוא גיאומטריה מקובץ. רוב הפורמטים של קבצים מולקולריים הגדולים נתמכים.
 
 Gabedit כולל חלון התקנת חישוב גאוס, Molcas, Molpro וMPQC המאפשר לך להגדיר עבודות גאוס, Molcas, Molpro וMPQC בצורה פשוטה וברורה.
 
 Gabedit כולל עורך טקסט לעריכת Molcas, Molpro, קבצי קלט גאוס וMPQC.
 
 Gabedit יכול גרפי להציג מגוון של גאוס, Molcas, Molpro, MPQC ו( באופן חלקי) את תוצאות חישוב ADF, כוללים את הפעולות הבאות:
 
 ย ท אורביטלים מולקולריים.
 ย ท משטחים מצפיפות האלקטרונים, הפוטנציאל אלקטרוסטטי, צפיפות מיגון NMR, ומאפיינים אחרים.
 ย ท משטחים עשויים להיות מוצג במצבי רשת מוצקים, שקופים וחוט.
 יכולים להיות בצבע ย ท משטחים על ידי רכוש נפרד.
 ย ท קווי מתאר (colorcoded).
 ย ท מטוסים (colorcoded).
 ย ท דיפול
 ย ท צירי XYZ והצירים העיקריים של המולקולה.
 ย ท אנימציה של המצבים נורמלים המתאימים לתדרי רטט.
 ย ท אנימציה של הסיבוב של גיאומטריה, שטח, דיפול, XYZ וצירים העיקריים של המולקולה.
 ย ท אנימציה של קווי המתאר.
 ย ท אנימציה של מטוסי colorcoded.
 
 Gabedit יכול להציג IR וראמאן מחושבים ספקטרום. Gabedit יכול ליצור קובץ Povray לגיאומטריה (אטומים + אג"ח, כוללים האג"ח של המימן), משטחים (כולל משטחי colorcoded), קווי המתאר, מטוסי colorcoded.
 
 Gabedit יכול לחסוך תמונה בPPM, BMP, (JPEG) ופורמט PS. Gabedit יכול ליצור באופן אוטומטי סדרה של תמונות לאנימציה (רטט, התכנסות גיאומטריה, סיבוב, קווי המתאר, מטוסי colorcoded)

מה חדש בהודעה זו:

• באגים קטנים תוקנו.
• NWChem נתמך כעת.
• משחקי יליד Windows נתמך כעת.

מה חדש בגרסת 2.3.5:.

• באגים קטנים תוקנו

יכולים להיות קבועים אטומים
• במהלך סימולציה דינמיקה מולקולרית.
• הגירה מקהיר לOpenGL לציור חלון הגיאומטריה.
• הגירה מgtkglarea לGtkGLExt.
• .
OpenMP באמצעות במקביל

מה חדש בגרסה 2.3.0:.

• באגים קטנים תוקנו
• .
המשתמש יכול לקרוא את אורביטלים, גיאומטריה ומצבים נורמלים מקובץ גאוס fchk
• אחד יכול לקרוא את אורביטלים מתבנית קובץ aux Mopac החדש (כולל הפורמט הדחוס).
• מספר אפשרויות חדשות בחלונות XYPlot וContoursPlot (טקסט להוסיף, קו, חץ, תמונות, ערכות נושא חדשות ...).
• יכולים להיות קבוע אורכי הקשר במהלך סימולציה MD.
• אופטימיזציה חלקית עכשיו זה אפשרי עם פוטנציאל MM.
• יישום כלי לחזות את ההמונים ושכיחותם של איזוטופים למולקולת נתונה. יישום של כלי כדי לחשב את הרגישויות אלקטרופיליות, nucleophilic ורדיקליות למולקולה.

מה חדש בגרסת 2.2.0:

• באגים קטנים תוקנו
• ניתן לבטל כל השינויים הגיאומטריים ומשופץ באמצעות (u / z U או Ctrl / y Ctrl) לבטל ולבצע שוב
• למשתמש יש שליטה מלאה על איגרות החוב מוצגים בציור.
• הציור של אטום מולקולת אטום כבר פשוטים.
• הציור של בר המולקולה על ידי בר שהופשט.
• Gabedit לקרוא connectivities מקבצי mol gabedit, הין, PDB, mol2 ו.
• המשתמש יכול להגדיר את הערך של המרחק, אג"ח הזווית וזווית dihedral.
• דינמיקה מולקולרית חיפוש קונפורמציה מיושם באמצעות פוטנציאל MM (99 אמבר).
• חיפוש קונפורמציה דינמיקה מולקולרית מיושם באמצעות שיטה חצי-אמפירית (מלהרחיב Mopac או PCGamess).
• הגירה מפונקציות ציור GDK לקהיר:. צלב-מכשיר העיבוד לVector Graphics
• קהיר משמש כיום ליישומון gabedit XYplot (בשימוש על ידי gabedit לתיקו ספקטרום).
• קהיר משמש כיום לחלון ציור הגיאומטריה.
• גיאומטריה ניתן לייצא בeps, PS, PDF או קובץ SVG.
• ניתן לייצא העקומות של חלון XYplot בeps, PS, PDF או קובץ SVG.
• כלי חדש למרחק מחשוב בין 2 נקודות על חלון XYPlot. & Quot; Control + משמרת כפתור & quot; יכול לשמש לעושה זום על חלון XYPlot.
• הגרסה החדשה של PCGamess (גחלילית) נתמך כעת

מה חדש בגרסת 2.1.13:

• באגים קטנים היו אידיאה
• דינמיקה מולקולרית חיפוש קונפורמציה מיושם באמצעות פוטנציאל MM (99 אמבר).
• חיפוש קונפורמציה דינמיקה מולקולרית מיושם באמצעות פוטנציאל חצי אמפירי (באמצעות Mopac או PCGAMESS).
• אפשר לייעל את הגיאומטריה אינטראקטיבית בשיטת Mopac או PCGamess למחצה אמפירי, מחלון הגיאומטריה Draw
• הגירה מפונקציות ציור GDK לקהיר: צלב-מכשיר עיבוד לוקטור גרפיקה. קהיר משמש כיום ליישומון gabedit XYplot (בשימוש על ידי gabedit לתיקו ספקטרום). קהיר משמש כיום לחלון ציור הגיאומטריה.
• גיאומטריה ניתן לייצא בeps, PS, PDF או קובץ SVG. העקומות של חלון XYplot ניתן לייצא בeps, PS, PDF או קובץ SVG.
• כלי חדש למרחק מחשוב בין 2 נקודות על חלון XYPlot. & Quot; Control + כפתור & quot שמאל; יכול לשמש לעושה זום על חלון XYPlot.
• הגרסה החדשה של מחשב Gamess / Firefly נתמך כעת

דרישות :

• GTK +