FlexS צופה קונפורמציה וכיוונו של אחד מligands ביחס לשני. בFlexS ההתייחסות ליגנד הנחה הוא להיות נוקשה, ובכך, אותו יש לתת בקונפורמציה שהוא דומה למצב הכפות. אלגוריתם סופרפוזיציה בFlexS דורש התערבות ידנית קטנה בלבד. אתה יכול לשלב את הידע הזה לחישובים עם FlexS על ידי ביצוע צעדים חד אופן ידני. לפיכך, FlexS מיועד לעבודה אינטראקטיבית בזוגות יגנד כמו גם להקרנה וירטואלית מבוסס יגנד. שני היישומים העיקריים של FlexS הם מיצוב סופר יגנד (למשל. לCoMFA / QSAR) והקרנה וירטואלית. אם יש לך חלבון ומולקולות קטנות מחייבים אותו (מה שנקרא התייחסות ליגנד) אבל אין מבנה של החלבון, אתה יכול לקחת את מבנה ההתייחסות כטביעת אצבע שלילית של האתר הפעיל. FlexS קובע את הדמיון בין המבחן ומבנה ההתייחסות על ידי יישורם. בהקרנה וירטואלית, יש לך התייחסות ליגנד וקבוצה של תרכובות ואתם מעוניינים במתן עדיפות לתרכובות לבדיקה ניסיונית.
תגובות לא נמצא