המאורעות העיקריים של החלק השני של המשחק מתרחשים 200 שנה לאחר תום מלחמת קליסן - בשנת 3300. האנושות מקיימת יחסים עם ארבע תרבויות מפותחות אחרות של הגלקסיה שלנו: המאלוקים, הפלנגים, הפאים ו הגאליאנים. הפעם כוח חדש ומסוכן עוד יותר מאיים על הגלקסיה. צורה חדשה...