BioRuby מספק סביבה משולבת לביואינפורמטיקה (מדעי מידע ביולוגיה).
יש שפת scripting מונחה עצמים רובי תכונות רבות מתאימות למחקר ביואינפורמטיקה, למשל, תחביר ברור להביע אובייקטים מורכבים, ביטויים רגילים לטיפול טקסט חזקים כמו פרל & rsquo; s, מגוון רחב של ספריות כוללים שירות אינטרנט וכו '
כתחביר רובי הוא פשוט ונקי מאוד, אנחנו מאמינים שזה קל ללמוד למתחילים, קל לשימוש עבור ביולוגים, וגם חזק מספיק למפתחי תוכנה.
בBioRuby, היזם יכול לאחזר ערכי מסד נתונים ביולוגיים מהקבצים שטוחים, שרתי אינטרנט אינטרנט ומסדי נתונים יחסיים מקומיים.
יכולים להיות מנותחים ערכי מסד נתונים אלה כדי לחלץ מידע שאתה צריך. ניתן לטפל ברצפים ביולוגיים עם השיטות להגשמה של רובי & rsquo; כיתת מחרוזת של ועם ביטויים רגילים.
הספרייה יכולה להיות משולבת עם כלים כמו פיצוץ, Fasta, Hmmer והרבה חבילות תוכנה אחרות לניתוח ביולוגי.
BioRuby תומך בפורמטי מסד נתונים ביולוגיים גדולים ומספק דרכים רבות לגישתם באמצעות אינדקס Flatfile, SQL, שירותי אינטרנט וכו 'שירותי אינטרנט שונים כולל API KEGG יכולים להיות מנוצלים בקלות על ידי BioRuby.
תכונות :
- BioRuby פגז
- API
- תיעוד
דרישות :
- רובי 1.8.7 או גבוה
תגובות לא נמצא