SimSoup הוא סימולטור כימיה מלאכותי גרפי עבור לינוקס ו- Windows.
התכנית מאפשרת לכימיה להיות מוגדרת במונחים של סוגי מולקולה ואינטראקציות אפשריות ביניהם. ריצת סימולציה כרוכה בהקמת מספר המולקולות של סוגי מולקולה שונים בכור, ולאחר מכן מאפשרת אינטראקציות להתקיים על פני תקופה של זמן. אינטראקציות המתרחשות בכור מוצגות בתצוגה גרפית.
המוטיבציה לפיתוח של התכנית היא לאפשר לחקירות ההתנהגות של רשתות, במיוחד ביחס ל'חילוף חומרים הראשון "תאוריות של מקור חיים, למרות שהעיצוב הבסיסי של SimSoup תומך מודלים של כל רשת שבאינטראקציות יכולות להתקיים בין צמתים.
נכון לעכשיו, הגיע פיתוח SimSoup שלב אב-טיפוס.
הנה כמה תכונות עיקריות של "SimSoup":
ย ท כימיה: כולל סוגי מולקולה וסוגי אינטראקציה
ย ท כור: באת קשרי גומלין שיתקיימו בין המולקולות מהסוגים השונים
ย ท צפיות גרפיים של הכימיה וכור המדינה
ย ท תצוגה גרפית של סטטיסטיקות סימולציה כוללים: -
- מגרשי סדרת זמן: אלה מראים סדרת זמן ההתנהגות של מגוון רחב של משתנים שנמצאים תחת פיקוח כריצות סימולציה
- מגרש מנהטן: זו מציגה את ההשתנות בהרכב החומר בכור לאורך זמן
ย ท עוקבים ומחזור איתור (חדש): אלה מאפשרים מחזורים כדי להתגלות ופיקוח
ย ท שימור מסה
ย ท חום ותרמודינמיקה (חדשה): שיעורי תגובה מבוססים על שיקולים של אנרגיה ותרמודינמיקה
ย ท תצוגת תרחיש: תצוגה של מידע תרחיש ומצב הנוכחי בהתקדמותה
ย ท בקשות פעולה (חדש): אלה הם אירועים שיכולים להיות שאמור להתקיים בזמנים מסוימים. לדוגמא, בקשת פעולה יכולה להיות התקנה לגרום מולקולה מסוג מסוים שיש להוסיף לכור
ย ท מעבד קלט (חדש): זה מאפשר תרחיש סימולציה להיות מוגדר בקובץ והעמיס לSimSoup
ย ท צג מערכת: מסך (מוסתר בחלקו) - בעיקר למטרות אבחון
ממשק משתמש משופר ย ท מבוסס באופן מלא על GTK (חדש)
דרישות:
ย ท GSL (הספרייה המדעית של גנים)
ย ท GTKMM (C ++ ממשק לספריית GTK + GUI)
מה חדש במהדורה זו:
ย ท עוקבים ומחזור איתור: אלה מאפשרים מחזורים כדי להתגלות ופיקוח
ย ท חום ותרמודינמיקה: שיעורי תגובה מבוססים על שיקולים של אנרגיה ותרמודינמיקה
ย ท בקשות פעולה: אלה הם אירועים שיכולים להיות שאמור להתקיים בזמנים מסוימים. לדוגמא, בקשת פעולה יכולה להיות התקנה לגרום מולקולה מסוג מסוים שיש להוסיף לכור
ย ท מעבד קלט: זה מאפשר תרחיש סימולציה להיות מוגדר בקובץ והעמיס לSimSoup
ממשק משתמש משופר ย ท מבוסס באופן מלא על GTK.
תגובות לא נמצא