מציג חלבון-חלבון ויגנד חלבון אינטראקציות כגרפים (רשתות), שבו מולקולות ביולוגיות מיוצגות כצומת ויחסי הגומלין שלהם מיוצגים כקישורים, היא גישה מבטיחה לשילוב תוצאות ניסוי ממקורות שונים כדי להשיג הבנה שיטתית של מנגנונים מולקולריים הנהיגה פנוטיפ תא. הופעתה של...

Genes2Networks הוא כלי תוכנה של שורת הפקודה, שניתן להשתמש למקום רשימות של גני יונקים בהקשר של רשתות signalome וinteractome יונקים רקע. הקלט לתכנית הוא רשימה של אדם Entrez ג'ין סימנים גן ורשתות רקע בפורמט SIG, ואילו התפוקה כוללת: את כל האינטראקציות...

היקף פרסומי מחקר נוסף מדי יום לבסיס האנושי-הידע על PubMed הוא מכריע. להישאר נוכחית עם המחקר האחרון הוא קריטי להצלחה של מדענים. PubMedAlertMe יכול לעזור למשתמשים לשמור על הקשר עדכני עם שאילתות PubMed האהובות עליהם. התכנית אמורה לרוץ או יומי או שבועי. אם...

פרופיל mRNA הגנום מספק תמונת מצב של המדינה הגלובלית של תאים בתנאים שונים. עם זאת, רמות ה- mRNA לא מספקות הבנה ישירה של מנגנוני רגולציה במעלה הזרם. Expression2Kinases (X2K) היא גישה חדשה לזיהוי רגולטורים במעלה הזרם סביר באחריות לשינויים שנצפו בביטוי הגנום...

GATE

GATE 2014

GATE (ניתוח הרשת של Time-Series ביטוי) הוא פלטפורמת תוכנה חישובית משולבת לניתוח ויזואליזציה של זמן-סדרה ביו-המולקולרית גבוהה-ממדית. GATE משתמש באלגוריתם אשכולות מבוסס מתאם לארגן זמן סדרה מולקולרית במערך משושה דו-ממדי ומשושים בודדים דינמי צבעים בהתאם לרמת...