MacVector הוא יישום מקיף מקינטוש המספק רצף עריכה, עיצוב פריימר, מסד נתונים באינטרנט חיפוש, ניתוח חלבון, אישור רצף, יישור רצף מרובים, שחזור פילוגנטי, ניתוח אזור קידוד, וכן מגוון רחב של פונקציות אחרות. MacVector נחשב נרחב ביותר אינטואיטיבי, קל לשימוש התוכנית זמינה עבור ניתוח רצף.
חלק מהבעיות הקטנות עם Align To Reference (קריאה ישרה) בעת קריאת האותיות שמתחילות בשאריות האחרונות של רצפים מעגליים תוקנו.
מה חדש בגירסה 16.0.6:יש כמה בעיות קלות עם יישור אל הפניה כאשר קורא מיושר מתחיל ב שאריות האחרון של רצפים עגולים תוקנה.
מה חדש בגרסה 16.0.2:
התרסקות בעת הפעלת היישור אל הפניה הוסף פונקציית Seqs ב- OS X 10.7 ו- OS X 10.8 תוקנה .
כאשר אתה מייצא רצף בפורמט GenBank, MacVector כותב כעת את כל תכונות GenBank, גם אם הן כרגע מיושנות.
מה חדש בגירסה 15.5.4:
הפלט האנזימי של הגבלת הפלט פועל כעת כצפוי כאשר בוחרים רק שניים או שלושה אנזימים.
מה חדש בגירסה 15.1.4:
תרגום המסגרת 3/6 בעורך הרצף היחיד שומר כעת את המסגרת בצורה נכונה
אחרי קו לעטוף.
התרסקות בעת הפעלת תרגום למסגרות 3/6 בעורך היישור אל הפניה באמצעות a
רצף גדול מ -65,000 שאריות תוקנו.
מה חדש בגירסה 15.1.3:
תוקן באג במערך היישור הרצף הרב-תכליתי . ההשפעה של באג זה היה כי שאריות נוספות הופיעו לפעמים בתחילת רצפים כאשר הם נשמרו. הדבר השפיע רק על מסמכי MSA שערכו. אם אתה רק מיושר עם ClustalW / שריר / T- קפה ושמר ללא עריכה, היישור יהיה נכון.
מה חדש בגירסה 15.1.1:
קריסות בעת שמירת מערך יישור רצף מרובה
(.msan, .msap) מסמכים נפתרו.
באג שבו כמה fastq קורא ייכתב החוצה מספר פעמים מהתוצאות של החיפוש Align to Folder תוקן.
מה חדש בגירסה 14.5.3:
התרסקות מדי פעם בפונקציה Align To Folder תוקנה.
התרסקות נדירה בעת בדיקת זוגות של פריימרים תוקנה
מה חדש בגירסה 14.5.2:
ישר אל תיקיה כעת מטפל נכון בחיפושים באמצעות קטע של רצף החוצה את המקור העגול.
הפעלה / כיבוי אוטומטי של "חיפוש חוזר" ב'מפה העדפות 'מעדכנת נכון את כל החלונות הפתוחים.
מה חדש בגירסה 14.0:
יחד עם הגברת הביצועים בעת עבודה עם רצפים גדולים ויישורים, קיימים שיפורים משמעותיים בטיפול הפריימר (כולל תמיכה במסדי נתונים של פריימר) ונתוני NGS.
מה חדש בגירסה 13.5.5:
בעיה שבה תכונות של סוג "????" תיווצר בעת פתיחת קובץ Align To Reference (.xml) שנשמר.
מה חדש בגירסה 13.5.3:
- תצוגת עורך ה- Contig מתרעננת כעת כראוי ב- OS X 10.6 בעת טעינת יישור שמור.
- התרסקות תוקנה בתיבת הניתוח של פרוטאין.
- התרסקות בממשק Quicktest Primer בעת עבודה עם מספר גדול של אנזימי הגבלה תוקן.
מה חדש בגירסה 13.5.2:
בעיית גלילה בעורך Contig / Align To Reference Reference נפתרה. התרסקות נדירה בעת התעוררות ברשת אחרת תוקנה.
מה חדש בגירסה 13.5.1:
- ב- OS X 10.6, רצפים מיובאים שומרים כעת את שם הקובץ המקורי שלהם.
- התרסקות מדי פעם שנסגרו רצפים ששונו שלא נשמרו תוקנו.
- תרגומים בפלט הטקסט שמופיע כעת מכבדים כעת את דגל ההעדפות.
- מספר סתירות במספור הרצפים "ללא שם" נפתרו.
- בעיה שבה חלונות הרצף ייעלמו תחת OS X 10.6 נפתרה,
- תוקנו מספר תקלות תצוגה בעורך 'יישור אל הפניה'.
- בעיה שבה חסרים לעתים תרגומים בכרטיסייה 'מפה' בעת הגדלה לרמת השאריות.
- ניתן לשחזר את היכולת לייבא קובצי BAM לפרויקט אסמבלר.
- מסמכי יישור מרובים של חומצה גרעין יש כעת קבוצת צבעים משלהם וחסימת ברירות מחדל.
- primers ב "מבחן PCR פריימר זוג" מצב של פריימר עיצוב יכול להיות עכשיו מעל 35 nt אורך.
- גודל תצוגות הטקסט משתנה כעת באופן אוטומטי ברוחב להדפסה בדף יחיד.
מה חדש בגירסה 13.5:
סמל הגרפיקה הגרפית והצופה הגרפי הצף נכתבו מחדש כהכנה ל- MacVector העובר לארכיטקטורה של 64 סיביות (הודות ל- MacVector 14.0). שיפורים עיקריים אחרים נועדו טיפול טוב יותר של הדור הבא רצף (NGS) קבצים, במיוחד עם יישור לתיקיה אסמבלר Velvet de novo הרכבה פונקציונליות. יש גם כמה אופטימיזציה קוד כדי להתמודד טוב יותר עם ניתוח של רצפים גנומי גדול, בולט במיוחד עם מטריקס Pustell "נקודה מגרש" פונקציונליות.
תגובות לא נמצא