פרויקט QMForge ניתן להשתמש כדי לנתח את התוצאות של כימיה קוונטית חישובים (DFT). גאוס 98/03, מזין מסמכים אוטומטי, GAMESS (ארה"ב), GAMESS (בריטניה), קבצי ORCA PC-GAMESS, יגואר, ונתמכים (ראה להלן). הניתוחים הבאים זמינים:
· Mulliken אוכלוסיית ניתוח (MPA)
· C בריבוע אוכלוסיית ניתוח (SCPA)
· חפיפת אוכלוסיית ניתוח (OPA)
· ההזמנות בונד של מאיר
· טעינת פירוק ניתוח (CDA)
· ניתוח שבר
MPA, CSPA, וOPA דורשים קבוצה המוגדרים על ידי משתמש של ברים, ומדפיס את תרומתם אחוזים שברים אלה עושים לקראת כל מולקולריים מסלולית במולקולה. הזמנות האג"ח של מאיר מחשבת את הזמנות קשר בין כל זוג אטומים במולקולה. CDA ושבר ניתוח דורשים שלושה או יותר חישובים (אחד לכל המולקולה, ושני חישובים שבר), ולספק מידע על יחסי הגומלין בין שברים מליטה.
QMForge הוא הצאצא הישיר של PyMOlyze, שנכתב בהשראה, (במקור) בלבד Windows AOMix מבוססת קונסולת התכנית שיש לו תכונות כוללים (ובנוסף ל) אלה שצוינו לעיל. אני בהתחלה כתבתי PyMOlyze כי רציתי ידידותי למשתמש (כלומר. גרפית) לינוקס תכנית לעשות MPA עבור כל מולקולרי מסלולית של חישובי גאוס. אני הרחבנו אותו כדי לטפל בקבצים מאופטימיזציות גיאומטריה כי מצאתי את עצמי מבקש יכולתי לתרגם ולסובב את המבנה מותאם ולשמור שכקובץ XYZ. עכשיו, זה כבר שינה את שם QMForge, ואני משתמש בו כמעט לכל דבר פרט לעשיית תמונות מסלולית מולקולריות ותרשימים.
יש עדיין כמה ניתוחים שQMForge לא עושה, כך שאם זה לא לטפל בצרכימים שלך, לבדוק את AOMix (או לירות לי מייל ונדברנו).
QMForge נוצר באמצעות שפת Python scripting, ערכת הכלים Qt4 והרחבות פיתון PyQt4, ספרות, וספריית ניתוח חבילת cclib compuational. זה נבדק על Windows XP, Windows 2000, ו- Mac OS X; זה אמור לעבוד באותה מידה בכל הפצת גנו / לינוקס, אם כי אני לא צריך לבדוק את זה עדיין.
מה חדש במהדורה זו:
· שינוי שם לQMForge
· תמיכת ORCA
· החלף ל numpy 1.0.2 וopenbabel 2.1.1
· שימושי cclib בנוי מ0.8 סניף + מנתח ORCA לא פורסם
תגובות לא נמצא