חדש ביואינפורמטיקה עבור Linux

פרויקט Geant4 הוא ערכת כלים לסימולציה של המעבר של חלקיקים דרך חומר.תחומי היישום שלה כוללים פיסיקה של אנרגיות גבוהות וניסויים גרעיניים, מחקרים רפואיים, מאיץ והפיזיקה החלל מה חדש בהודעה זו :. דגם חדש של אינטראקציות גרעיניות גמא באמצעות המפל ברתיני...

פרויקט STEME התחיל את חיי כקירוב לאלגוריתם הציפייה-Maximisation לסוג של מודל המשמש במד מוטיב כגון מם.STEME & rsquo; קירוב EM של פועל בסדר גודל יותר מהר מאשר יישום מם להגדרות פרמטר טיפוסיים. STEME עכשיו התפתח מאתר מוטיב באופן מלא לכל דבר בפני עצמו. למה...

Genepidgin היא חבילה של כלים Python המסייעים בשמות אחרים של מוצרים והערכת גן המשימה & nbsp; יש שלושה מרכיבים עיקריים.:genepidgin * נקי *& Nbsp; סטנדרטיזציה גן שמות להנחיות שמות Uniprotgenepidgin * להשוות *& Nbsp; משווה שניים או יותר סטים של שמות...

קפסיד הוא פלטפורמה מקיפה קוד פתוח המשלבת צינור חישובית ביצועים גבוהים עבור רצף הפתוגן זיהוי & nbsp; ואפיון בהגנום וtranscriptomes אנושיים יחד עם מסד נתונים תוצאות מדרגי ומבוסס אינטרנט יישום תוכנה ידידותי למשתמש לניהול, ביצוע שאילתות באופן חזותי תוצאות....

מיסו (תערובת של isoforms) היא מסגרת הסתברותי נכתבה בפייתון שquantitates הרמה & nbsp ביטוי; של גני שחבור חלופיים מנתוני RNA-Seq, ומזהה isoforms או אקסונים דיפרנציאלי מוסדרים במדגמים.על ידי דוגמנות התהליך המחולל על ידי אשר קורא מיוצרים מisoforms בRNA-Seq,...

MACS2 הוא כלי ניתוח מודל המבוסס על נתונים שבב Seq.עם השיפור של טכניקות רצף, immunoprecipitation הכרומטין ואחריו רצף תפוקה גבוה (שבב Seq) הוא מקבל פופולרי ללמוד אינטראקציות החלבון-DNA הגנום. כדי לטפל בחוסר שיטת ניתוח שבב Seq החזק, אנו מציגים אלגוריתם רומן,...

biotools היא חבורה של ביואינפורמטיקה כלי עזר נכתב בפייתון דרישות :. ...

PathVisio הוא קוד פתוח ויישום גרפי לגמרי בחינם מיושם בשפת תכנות ג'אווה ותוכנן מהיסוד כדי לשמש להצגה, ניתוח ועריכת מסלולים ביולוגיים תחת הפעלה GNU / Linux system.Can לשמש לצייר מסלולים , לקשר תוכנת entitiesThe ביולוגית מאפשרת למשתמשים לצייר מסלולים,...

Pathomx (לשעבר MetaPath) היא תוכנת קוד פתוח גרפית מיושמת בIPython, Qt וPyQt, תוכננה מהיסוד עד לשמש ככלי אינטראקטיבי להדמיה והניתוח של נתונים מטבולים תחת GNU / Linux וPOSIX האחר & nbsp; הפעלה מערכות. בתחילה תוכנן לו לשמש לעיבוד data.Features metabolomics...