חייב להיות ביואינפורמטיקה עבור Linux

ProteinShop הוא כלי אינטראקטיבי למניפולצית מבנים חלבוניים. הוא נועד ליצור קבוצה של תצורות חלבון באמצעות ידע ואינטואיציה אנושיים במהירות. יכולות להיות נתונה תצורות אלה לאופטימיזציה מקומית או גלובלית. למרות ProteinShopאינו מבצע אופטימיזציה של התהליך הגלובלי...

pyNetConv היא ספריית פייתון נוצרה כדי לעזור המרה של כמה פורמטים של קבצים ברשת.מאז גרסה 0.6, pyNetConv מסוגל קריאה / כתיבה (ולהמיר מ / ל) הפורמטים של הקבצים...

Pysam הוא מודול פייתון לקריאה ולמניפולצית Samfiles & nbsp;. זה עטיפה קלה של C-API samtools.המדריך להתחלה מהירה היא כאן. תיעוד מפורט יותר זמין כאן.שאלות והערות תתקבלנה בברכה, ויש לשלוח לקבוצת המשתמשים pysam...

PySCeS הוא פרויקט שפותח על ידי Triple-J הקבוצה למולקולרי של תא פיזיולוגיה & nbsp;. על מנת לנסות מודל ולהבין את התהליכים המורכבים ומערכות המרכיבים את התא החי תכונות :. מודול ניתוח מבני. משלבי לסימולציה בזמן פותרים שאינם ליניארי לניתוח מצב יציב ...

reciprocal_smallest_distance הוא אלגוריתם orthology pairwise המשתמש ביישור רצף גלובלי ומרחק האבולוציוני סבירות המרבית בין רצפים במדויק למזהה orthologs בין הגנום. התקנה מtarball הורד וuntar את הגרסה האחרונה מGitHub:cd ~ס תלתל...

מתכנן RFLP הוא כלי שעוזר לתכנן ניסוי RFLP: הוא מוצא אנזימי הגבלה, כי לחתוך קבוצה של רצפי DNA homologue בדרכים שונות ומדמה את תמונת אלקטרופורזה ג'ל וכתוצאה מכך. התכנית מסייעת לך למצוא את אנזימי הגבלה החיוניים המאפיינים את האוכלוסייה. עם הסימולציה...

חותם הוא מודול פייתון שמספק יישור רצף על Hadoop.חותם הוא יישום של MapReduce יישור רצף ביולוגי. היא פועלת על Hadoop (http://hadoop.apache.org) דרך Pydoop (http://pydoop.sourceforge.net), API Python MapReduce וHDFS לHadoop. דרישות : ...

seriesoftubes הוא צינור ארוך לנתונים שבב seq Solexa.תיעוד חבילה דרישות : ...

לבנות מערכות כמו איפור משמש לעתים קרובות כדי ליצור זרימות עבודה מסובכות, למשל ביואינפורמטיקה & nbsp;. snakemake שואף לצמצם את המורכבות של תהליכי עבודה יצירת על ידי מתן שפה נקייה ומודרנית תחום ספציפי מפרט (DSL) בסגנון פיתון, יחד עם סביבת ביצוע מהירה ונוחה....

SSuMMo היא ספרייה של פונקציות תוכננו סביב איטרטיבי באמצעות hmmer להקצות רצפים למינים & nbsp;. תוצאות הן עצים מבואר מאוד מראים מינים / סוג הפצה בתוך הקהילה ש.תוכניות כלולות בקוד המקור כוללות כלים ל: -- בניית מסד נתונים היררכיים של מודלי מרקוב נסתרים -...