חייב להיות ביואינפורמטיקה עבור Linux

גובים הוא API Python לקריאת קבצי נתונים בינאריים שנוצר באמצעות מסגרת ניהול נתונים גובי הדור הבא.בדרך כלל, במדריך זה מגיע כחלק מחבילת הגובים השלמה, זמין מ:& Nbsp; http: //goby.campagnelab.org/החבילה המלאה כוללת את קוד מקור Java. אם הורדת חבילה זו מPyPI או...

. HTSeq היא מסגרת פייתון לעבד ולנתח נתונים מרצף תפוקה גבוהה (HTS) מבחני דרישות : < li>...

Jmol הוא קוד פתוח, חוצה פלטפורמה ותוכנה גרפית חופשית אשר תוכננה במקור לפעול כצופה מולקולרי למבנים כימיים תלת-ממדיים. הוא פועל בארבעה מצבים עצמאיים, כמו יישום אינטרנט HTML5, תוכנית Java, יישומון Java, ו "ללא ראש" בצד השרת רכיב. מתעלם במבט אחד תכונות...

LSim superposes צפיפות אלקטרונים macromolecular ומחשב ציון דמיון מבני. החישובים שלה בקנה מידה באופן ליניארי עם הגודל של המולקולות מושווים.יישור LSim הוא מושגית שאינו קשור לאלמנטים מבניים ביוכימיים, ולכן, אינם מוטים ומתאימים ללימודי דמיון חלבון מבנה...

MacMolPlt היא תכנית הגרפיקה מודרנית לזוממים מבנים מולקולריים 3-D ומצבים נורמלים (תנודות). אמצעים...

MACS2 הוא כלי ניתוח מודל המבוסס על נתונים שבב Seq.עם השיפור של טכניקות רצף, immunoprecipitation הכרומטין ואחריו רצף תפוקה גבוה (שבב Seq) הוא מקבל פופולרי ללמוד אינטראקציות החלבון-DNA הגנום. כדי לטפל בחוסר שיטת ניתוח שבב Seq החזק, אנו מציגים אלגוריתם רומן,...

חבילת ספקטרומטר מסה massXpert היא סביבת ספקטרומטר מסה ליניארי (ביולוגי) פולימרים. זה יורש את כל החידושים של polyxmass של גנו, כפי שהוא יציאתו של פרויקט שלסביבת פיתוח פלטפורמות מה חדש בהודעה זו:. שיפורים במודול XpertMiner שיהפכו את העבודה עם...

MetagenomeDB היא ספריית פייתון נועד לאחסן בקלות, לאחזר ויסמנו רצפי metagenomic & nbsp;. מעשה MetagenomeDB כשכבת הפשטה על גבי מסד נתוני MongoDB. הוא מספק API כדי ליצור ולשנות ולחבר את שני סוגים של אובייקטים, כלומר רצפים ואוספים:& Nbsp; * רצפים (כיתת רצף)...

מיסו (תערובת של isoforms) היא מסגרת הסתברותי נכתבה בפייתון שquantitates הרמה & nbsp ביטוי; של גני שחבור חלופיים מנתוני RNA-Seq, ומזהה isoforms או אקסונים דיפרנציאלי מוסדרים במדגמים.על ידי דוגמנות התהליך המחולל על ידי אשר קורא מיוצרים מisoforms בRNA-Seq,...

mpiBLAST הוא יישום מקביל מבוסס MPI של תפציץ צמח השדה. הפרויקט מורכב משתי תוכניות שתחלפנה formatdb וblastall עם גרסאות שביצוע עבודות פיצוץ במקביל באשכול של מחשבים עם MPI המותקנים. ישנם שני יתרונות עיקריים לשימוש בmpiBLAST לעומת פיצוץ מסורתי.ראשית, mpiBLAST...