הטוב ביותר ביואינפורמטיקה עבור Linux

פרויקט Geant4 הוא ערכת כלים לסימולציה של המעבר של חלקיקים דרך חומר.תחומי היישום שלה כוללים פיסיקה של אנרגיות גבוהות וניסויים גרעיניים, מחקרים רפואיים, מאיץ והפיזיקה החלל מה חדש בהודעה זו :. דגם חדש של אינטראקציות גרעיניות גמא באמצעות המפל ברתיני...

pyNetConv היא ספריית פייתון נוצרה כדי לעזור המרה של כמה פורמטים של קבצים ברשת.מאז גרסה 0.6, pyNetConv מסוגל קריאה / כתיבה (ולהמיר מ / ל) הפורמטים של הקבצים...

Jmol הוא קוד פתוח, חוצה פלטפורמה ותוכנה גרפית חופשית אשר תוכננה במקור לפעול כצופה מולקולרי למבנים כימיים תלת-ממדיים. הוא פועל בארבעה מצבים עצמאיים, כמו יישום אינטרנט HTML5, תוכנית Java, יישומון Java, ו "ללא ראש" בצד השרת רכיב. מתעלם במבט אחד תכונות...

GDIS הוא GTK תכנית מבוססת על התצוגה והמניפולציה של מולקולות בודדות ומערכות תקופתיות. תוכנה זו היא בפיתוח, אבל בכל זאת די פונקציונלי.הנה כמה תכונות עיקריות של...

CLC רצף Viewer יוצר סביבת תוכנה המאפשרת למשתמשים לבצע ביואינפורמטיקה הבסיסית ניתוחים וניהול נתונים חלקים, בשילוב עם אפשרויות צפייה ופלט גרפיות מצוינות.הנה כמה תכונות עיקריות של "CLC Workbench חינם":- GenBank חיפוש והצגה (ליניארי ונוף מעגלי)- יישור מרובה...

PathVisio הוא קוד פתוח ויישום גרפי לגמרי בחינם מיושם בשפת תכנות ג'אווה ותוכנן מהיסוד כדי לשמש להצגה, ניתוח ועריכת מסלולים ביולוגיים תחת הפעלה GNU / Linux system.Can לשמש לצייר מסלולים , לקשר תוכנת entitiesThe ביולוגית מאפשרת למשתמשים לצייר מסלולים,...

Pysam הוא מודול פייתון לקריאה ולמניפולצית Samfiles & nbsp;. זה עטיפה קלה של C-API samtools.המדריך להתחלה מהירה היא כאן. תיעוד מפורט יותר זמין כאן.שאלות והערות תתקבלנה בברכה, ויש לשלוח לקבוצת המשתמשים pysam...

CodonW היא תכנית שנועדה לפשט את הניתוח רב משתני (ניתוח התכתבות) של שימוש בחומצת אמינו וקודון. הוא גם מחשב מדדים סטנדרטיים של שימוש קודון. יש לו שני תפריט וממשקי שורת הפקודה.פרויקט CodonW נכתב על ידי ג'ון Peden במעבדה של פול שארפ, מחלקה לגנטיקה,...

AHREA היא חבילת תכנה שהופכת את מציאת ביטוי יחסי לומדים קלים. . זה כתוב בפייתון דרישות : ...

mpiBLAST הוא יישום מקביל מבוסס MPI של תפציץ צמח השדה. הפרויקט מורכב משתי תוכניות שתחלפנה formatdb וblastall עם גרסאות שביצוע עבודות פיצוץ במקביל באשכול של מחשבים עם MPI המותקנים. ישנם שני יתרונות עיקריים לשימוש בmpiBLAST לעומת פיצוץ מסורתי.ראשית, mpiBLAST...