Staden החבילה היא קבוצה מפותחת של הרכבה רצף ה- DNA (Gap4), עריכה וכלי ניתוח (ספין) ליוניקס, לינוקס, MacOSX ו- MS Windows.
בחזית Gap4 היו כמה קטין הצטרפות קשור
שיפורים באיך זה עשרות מצטרף מצא פנימי מצטרף ו
הפונקציונליות של כפתור היישור בעורך הצטרף.
גם של תוצאה לgap4 הם השינויים השונים לio_lib (
ספרייה לכל הקלט / פלט לקבצים בפורמטים שונים עקבות). עם התוספת
של תכנית hash_exp חדשה זה מאפשר כעת לקבצי ניסוי להיות
שרשור יחד וצמוד. הרשימה של שמות קבצי ניסוי
צריך Stil יסופק לgap4, אבל סיפק את סביבת EXP_PATH
משתנים כבר מוגדר כהלכה gap4 תוכל להביא בודד
רצפים מתוך קובץ ניסוי בשרשור
ארכיון. שיפורים לממשק משתמש לזו עדיין צריכה להיות
עשה.
454 ארכיוני SFF עכשיו נתמכים טובים יותר. 454 מדדי defsult
עכשיו לעבוד, אם כי ניתן להשתמש בתכנית hash_sff לספק
אסטרטגיה חלופית לאינדקס (אולי מהר יותר בחלק ממקרים).
Gap4 וטךב גם אחרת בסגנון תצוגת עקבות עקבות ש
יש לי סריקת 1 מדגם (ערוצי x4) לקריאת בסיס. במקרה זה יכול
גם לצייר 4 ערכי ביטחון במקום 1 לבסיס. יכולות אלו
שילוב טוב יותר יאפשר לSolexa עוקב כאשר בקלות רבה יותר
זמין.
בנוסף כמובן התמהיל הרגיל של תיקוני באגים ושיפורים קלים. ראה
יומן מלא שינוי לפרטים (דרך אתר SourceForge).
שינויים בולטים אחרים
Gap4
תגובות לא נמצא