צילום מסך תוכנה:
פרטי תוכנה:
מיסו (תערובת של isoforms) היא מסגרת הסתברותי נכתבה בפייתון שquantitates הרמה & nbsp ביטוי; של גני שחבור חלופיים מנתוני RNA-Seq, ומזהה isoforms או אקסונים דיפרנציאלי מוסדרים במדגמים.
על ידי דוגמנות התהליך המחולל על ידי אשר קורא מיוצרים מisoforms בRNA-Seq, מודל מיסו משתמש היקש בייס כדי לחשב את ההסתברות שקריאת מקורם איזופורם מסוים.
מיסו משתמש במשימה מוסקות של קורא לisoforms לכמת את שכיחותם של הסט הבסיסי של isoforms mRNA החלופי. ניתן להשיג ביטחון מרווחים מעל אומדנים, הלכמת את מהימנות האומדנים.
אנא ראה http://genes.mit.edu/burgelab/miso/docs/ למדריך למיסו ותיעוד
דרישות :.
- Python
תגובות לא נמצא